Implication de la SUMOylation dans la modulation de la réponse transcriptionnelle du riz à la suite d'un stress de haute température

Diongue, Mariama (2025). « Implication de la SUMOylation dans la modulation de la réponse transcriptionnelle du riz à la suite d'un stress de haute température » Mémoire. Montréal (Québec), Université du Québec à Montréal, Maîtrise en biochimie.

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Résumé

L'exposition des plantes à des températures élevées entraîne des changements dans l'expression des gènes. Ces changements sont dus à une réorganisation des régulateurs transcriptionnels en partie sous l'action de modifications post-traductionnelles comme la SUMOylation. Celle-ci dépend d'une cascade enzymatique qui comprend une E3 ligase facilitant le transfert d'une petite protéine, SUMO, sur des substrats protéiques. Considérant l’importance des SUMO E3 ligases dans la réponse au stress de haute température (HT) chez la plante Arabidopsis thaliana, ce projet vise à déterminer comment deux SUMO E3 ligases chez le riz, OsSIZ1 et OsSIZ2, contribuent à la modulation transcriptionnelle des gènes dans des conditions de stress de HT. Pour déterminer les changements transcriptionnels liés à un stress de HT, nous avons utilisé l’approche ChIP-Seq (Immunoprécipitation de la chromatine suivie de séquençage à haut débit) au moyen d’un anticorps commercial anti-SUMO, amorçant la cartographie des sites SUMO. Des ChIP-qPCR ciblées ont confirmé l’enrichissement attendu sur les promoteurs d’OsHSFA2d et OsHSFA6 et suggéré un axe mitochondrie-noyau via OsETFβ. Pour relier ces signaux à l’activité enzymatique, nous avons modélisé les structures tridimensionnelles des protéines afin de sélectionner le domaine le plus conservé des deux protéines homologues (SP-RING) des ligases. Les protéines obtenues après expression et purification ont été injectées dans des lapins pour produire des anticorps polyclonaux. Ces anticorps anti-OsSIZ1/2, validés par IP-qPCR in vitro, montrent une coprécipitation d’ADN renforcée pour les constructions SAP+ (contenant le domaine de liaison à l’ADN), attestant de leur spécificité. Les outils développés permettront prochainement un ChIP-Seq ciblé sur OsSIZ1/2 en conditions de HT, afin d’identifier les séquences régulées et d’inférer les facteurs de transcription SUMO-dépendants. À long terme, cette étude facilitera le développement de nouvelles stratégies biotechnologiques permettant aux chercheurs et aux agronomes d’augmenter la résilience des plantes dans un contexte de changements climatiques et pourrait également être étendue à d’autres stress, tels que la sécheresse. _____________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : SUMOylation, stress de haute température, expression et purification de protéines, modifications post-traductionnelles, régulation transcriptionnelle, immunoprécipitation de la chromatine

Type: Mémoire accepté
Informations complémentaires: Fichier numérique reçu et enrichi en format PDF/A.
Directeur de thèse: Joly-Lopez, Zoé
Mots-clés ou Sujets: SUMOylation / Stress dû à la chaleur / Riz / Régulation transcriptionnelle / Protéines SUMO / Ligases / Tolérance thermique / Résilience climatique
Unité d'appartenance: Faculté des sciences > Département de chimie
Faculté des sciences > Département des sciences biologiques
Déposé par: Service des bibliothèques
Date de dépôt: 12 nov. 2025 08:38
Dernière modification: 06 mars 2026 13:58
Adresse URL : https://archipel.uqam.ca/secure/id/eprint/19224

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