Lépine, Maggy (2024). « Développement de méthodes quantitatives ciblées pour l'analyse de larmes humaines par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem » Thèse. Montréal (Québec), Université du Québec à Montréal, Doctorat en biochimie.
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Résumé
L’étude protéomique des larmes est une nouvelle approche utilisée afin d’étudier les différentes variations dans le protéome lacrymal. Comme ces protéines jouent un rôle important dans la santé oculaire, une modification de la quantité ou la qualité de certaines protéines peut corréler avec une maladie spécifique. Néanmoins avant de faire l’étude de ces maladies, il est important de caractériser les variations normales provoquées par les différents stimulis auquel la surface oculaire est exposée afin de maintenir la santé ainsi que l’homéostasie. L’objectif de ce projet de recherche est de développer une approche analytique non invasive robuste et sensible par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem afin d’identifier et de quantifier les protéines dans les larmes humaines afin d’évaluer les variations dans le protéome lacrymal. Une préparation des échantillons de larmes au moyen d’une stratégie d’analyse protéomique de type ascendant ainsi qu’une analyse par LC-MS/MS ont tout d’abord été développées permettant une identification optimale des protéines oculaires. L’utilisation d’une analyse non ciblée en mode dépendantes des données a permis d'établir une base de données complète des différentes protéines retrouvées dans le liquide lacrymal. Le développement de méthode ciblé a ensuite permis d’évaluer les variations du protéome chez des individus sans pathologie de la surface oculaire. L’étude des variations chez les individus sans pathologie a permis de mieux comprendre le dynamisme des voies biologiques dans le protéome lacrymal et ainsi de donner la possibilité de prioriser les éventuelles protéines d'intérêt dans le contexte des biomarqueurs de maladies. Un flux de travail combinant les analyses quantitatives SWATH non ciblées et l'analyse MRM ciblée a été développé pour la sélection et la vérification des biomarqueurs potentiels dans des échantillons de patient souffrant de deux maladies oculaires : le syndrome de Sjögren ainsi que le pemphigoïde muqueux membranaire. Ces maladies ont relevé une liste respective de 64 et 56 biomarqueurs d’intérêt impliqués dans plusieurs voies biologiques. Les méthodes mises au point dans le cadre de ce projet pourraient être utiles pour étudier plusieurs autres maladies oculaires permettant de mieux diagnostiquer les patients atteints de même que d'identifier le stade d'une maladie oculaire, mais également de prévoir la progression de la maladie et d'optimiser de nouvelles approches thérapeutiques pour soigner les patients atteints. _____________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Protéomique, Protéome oculaire, Maladie oculaire, Quantification, Biomarqueurs, LC-MS/MS
| Type: | Thèse ou essai doctoral accepté |
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| Informations complémentaires: | Fichier numérique reçu et enrichi en format PDF/A. |
| Directeur de thèse: | Sleno, Lekha |
| Mots-clés ou Sujets: | Larmes -- Analyse / Protéines de l'œil / Protéomes / Protéomique / Maladies de l'œil / Marqueurs biologiques / Chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse |
| Unité d'appartenance: | Faculté des sciences > Département de chimie Faculté des sciences > Département des sciences biologiques |
| Déposé par: | Service des bibliothèques |
| Date de dépôt: | 26 sept. 2024 13:35 |
| Dernière modification: | 26 sept. 2024 13:35 |
| Adresse URL : | http://archipel.uqam.ca/id/eprint/18057 |
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