Patel, Divya
(2023).
« Colonisation de surfaces rocheuses par des microorganismes dans un aquifère à Covey Hill » Mémoire.
Montréal (Québec), Université du Québec à Montréal, Maîtrise en biologie.
Fichier(s) associé(s) à ce document :
Résumé
La plupart des études sur les communautés microbiennes dans les aquifères se sont concentrés sur les communautés planctoniques. Cependant, depuis quelques années, des études montrent qu’il y a une grande diversité de microorganismes sessiles dans ces milieux. Maintenant qu’il y a un plus grand intérêt sur la diversité des microorganismes sessiles, cette étude vise à contribuer aux découvertes portant sur ces communautés en les comparant aux communautés planctoniques. Nous avons ainsi étudié l’impact de des caractéristiques abiotiques des roches (rugosité et composition minéralogique) sur la colonisation des surfaces des roches. Nous hypothétisons que les microorganismes présents à la surface rocheuse seraient des organismes planctoniques devenus sessiles. L’ autre hypothèse est que les propriétés géologiques des roches influencent la structure des communautés microbiennes pouvant s’y installer. Pour ce projet, nous avons échantilloné de l’eau venant d’un aquifère à Covey Hill. Des pastilles stériles de roches venant du site ont été placées dans un système ouvert de bioréacteurs et l’eau souterraines contenant une communauté planctonique intitiale y a été pompé. Nous avons ensuite identifié la taxonomie des microorganismes ayant évolué dans l’eau et ayant colonisé la surface des roches grâce au séquençage amplicon des gènes procaryote ARNr 16S et eucaryote ARNr 18S. Un scanner 3D a été utilisé pour mesurer la rugosité et la composition minéralogique a été mesuré avec Ilastik. On a trouvé qu’il y avait beaucoup de microorganismes dans les deux communautés et que la rugosité n’avait qu’un faible effet sur l’abondance de bactéries sur les surfaces. De plus, il n’y a que le quartz qui avait un effet significatif sur la composition de la communauté bactérienne. Cette étude a permis de mieux comprendre l’influence des microorganismes planctoniques sur la communauté sessile, ainsi que l’influence de la minéralogie sur les communautés sessiles.
_____________________________________________________________________________
MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : : communauté microbienne, communauté planctonique, communauté sessile, composition minéralogique, séquençage Amplicon
RECHERCHER
PARCOURIR
LIBRE ACCÈS
