Pokhrel, Daman Singh (2022). « Characterization and in vivo nuclear magnetic resonances study of the bacterium aeromonas salmonicida responsible for furunculosis in salmonids » Mémoire. Montréal (Québec, Canada), Université du Québec à Montréal, Maîtrise en biochimie.
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Résumé
Aeromonas salmonicida sous-espèce salmonicida (A.s.s.) est un agent pathogène responsable d'une maladie appelée « furonculose » chez les poissons, notamment les truites et les saumons. La présence d'une "couche A" et le développement de gènes de résistance aux antibiotiques rendent cette bactérie nuisible à l'aquaculture. La résonance magnétique nucléaire à l'état solide in vivo (RMN-ÉS) est un outil puissant et non invasif qui révèle la dynamique des phospholipides au niveau moléculaire, en sondant l'ordre de leurs chaînes acyles dans des bactéries intactes. L'objectif principal de ce projet était d'établir une stratégie de marquage au deutérium des membranes d'A.s.s., et d’en réaliser une caractérisation biophysique par RMN-ÉS du 2H in vivo. Nous avons utilisé deux souches d'A.s.s., R3 et R5 respectivement avec et sans couche A. Nous avons optimisé la température de croissance, ainsi que le choix du détergent et des acides gras exogènes (AG) nécessaires au marquage. Le marquage avec 0,15 mM de Tween-20 et un rapport équimolaire de 0,1 mM d'acide palmitique deutéré (PAd31) et d'acide oléique (OA) a presque conservé le profil natif des AG saturés/insaturés, comme montré par GC/MS. La RMN du 31P en solution n'a montré aucun changement dans le profil des têtes des lipides. Un niveau de deutération de presque 30 % de tous les AG a été atteint, suffisant pour fournir un rapport signal/bruit adéquat en RMN-ÉS du 2H. Pour évaluer la réactivité des souches A.s.s. deutérées aux changements de dynamique des lipides, nous avons enregistré des spectres de RMN-ÉS en fonction de la température (8, 18 et 28° C). Les résultats ont montré que la membrane marquée était plus fluide lorsque la température augmentait. Ce projet présente la première deutération de membranes de A.s.s., et jette les bases pour étudier le mécanisme d'action d’agents antimicrobiens dans des recherches futures. _____________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : résistance aux antibiotiques, RMN de l’état solide du 2H in vivo, bactéries aquatiques, analyse des phospholipides, RMN du 31P en solution
| Type: | Mémoire accepté |
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| Informations complémentaires: | Fichier numérique reçu et enrichi en format PDF/A. |
| Directeur de thèse: | Marcotte, Isabelle |
| Mots-clés ou Sujets: | Résistance bactérienne aux antibiotiques / Aeromonas salmonicida / Membrane cellulaire / Analyse des phospholipides / Résonance magnétique nucléaire / Furonculose des salmonidés / Aquaculture |
| Unité d'appartenance: | Faculté des sciences > Département de chimie Faculté des sciences > Département des sciences biologiques |
| Déposé par: | Service des bibliothèques |
| Date de dépôt: | 14 oct. 2022 14:15 |
| Dernière modification: | 14 oct. 2022 14:15 |
| Adresse URL : | http://archipel.uqam.ca/id/eprint/15887 |
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