Sansoucy, Maxime
(2021).
« Étude de protéines impliquées dans la biosynthèse de byssus chez la moule par spectrométrie de masse en tandem » Thèse.
Montréal (Québec, Canada), Université du Québec à Montréal, Doctorat en chimie.
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Résumé
Plusieurs organismes, comme les araignées, les vers à soie et les moules fabriquent des substances à base de protéines afin de répondre à des demandes particulières. Certains de ces bio-polymères offrent des propriétés anti-bactérienne intéressantes alors que certains possèdent des capacités élastiques, de résistance à la déformation et même d’adhésion particulièrement intéressantes. Plus précisément, dans le cas des moules, celles-ci fabriquent un polymère à base de protéines et de collagène qui surpasse la soie d’araignée. Cette «soie» connue comme le byssus offre une adhésion sous-marine qui a motivé les recherches en bioingénérie depuis les trois dernières décennies. Les efforts des dernières années se sont essentiellement concentrés sur l’étude et la caractérisation des fibres de byssus afin, d’une part, d’en élucider la composition moléculaire et, d’autre part, de comprendre l’origine de son élasticité et adhésion. En dépit de la diversité des approches analytiques utilisées (chrystalographie des rayons X, spectroscopie par résonance magnétique nucléaire et spectrométrie de masse), l’identité des protéines produites par la moule et celles impliquées dans la fabrication de la fibre de byssus demeure encore limitée à une poignée de candidats. Les récentes avancées en matière de résolution, de sélectivité et de rapidité ont permis à la spectrométrie de masse de devenir la technique par excellence pour les analyses protéomiques. Plus précisément, la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem a largement contribué aux développements de diverses applications de la protéomique. La présente dissertation a été organisée autour de la préparation des échantillons et du traitement des données afin d’identifier les protéines impliquées dans la biosynthèse du byssus. Dans un premier temps, différentes approches de pré-fractionnement de peptides ont été comparées à une méthode sans pré-fractionnement. Une analyse comparative entre les tissus de pied, de manteau et de byssus a été réalisée dans le but de révéler les protéines de byssus. Ensuite, une approche intégrant transcriptomique et protéomique a été réalisée à partir du transcripte de la moule M. edulis. Finalement, une étape plus spécifique sur une protéine recombinante a permis d’étudier la chimie de son groupement catéchol.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : protéomique ascendante, LC-MS/MS, moule, byssus, byssogénèse
| Type: |
Thèse ou essai doctoral accepté
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| Informations complémentaires: |
Fichier numérique reçu et enrichi en format PDF / A. |
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Directeur de thèse: |
Sleno, Lekha |
| Mots-clés ou Sujets: |
Byssus -- Synthèse / Mytilus / Protéomique / Spectrométrie de masse en tandem / Chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse |
| Unité d'appartenance: |
Faculté des sciences > Département de chimie |
| Déposé par: |
Service des bibliothèques
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| Date de dépôt: |
29 oct. 2021 14:41 |
| Dernière modification: |
29 oct. 2021 14:41 |
| Adresse URL : |
http://archipel.uqam.ca/id/eprint/14729 |
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