Analyse de l'épissage alternatif et d'un gène COR de fonction inconnue lors de l'acclimation au froid chez le blé d'hiver

Tamouya Tatientse, Karl Michael (2018). « Analyse de l'épissage alternatif et d'un gène COR de fonction inconnue lors de l'acclimation au froid chez le blé d'hiver » Mémoire. Montréal (Québec, Canada), Université du Québec à Montréal, Maîtrise en biochimie.

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Résumé

Parmi les différents facteurs abiotiques, la température et l’eau sont les éléments qui ont régi la distribution géographique des plantes. Dans cette étude, nous nous sommes intéressés à l’impact du froid sur le blé d’hiver. Ainsi, les plantes survivent aux basses températures à l’aide d’un phénomène connu sous le nom d’acclimatation au froid. Bien qu’il fût caractérisé chez de nombreuses espèces de plantes, il reste encore beaucoup de choses à découvrir et à exploiter. Des études ont révélé qu’à la suite d’une exposition au froid, les plantes subissent un stress qui agit au niveau cellulaire avec comme conséquence majeure, une modification de l’expression des gènes qui aboutira à des plantes tolérantes ou sensibles. Cette modification de l’expression des gènes se fait au niveau, transcriptionnel, post-transcriptionnel et post-traductionnel. Pour notre étude, nous nous sommes intéressés d’une part sur une modification post-transcriptionnelle, l’épissage alternatif car il est impliqué dans l’adaptation des plantes aux stress environnementaux. Pour cela, nous avons examiné l’expression et l’épissage alternatif de plusieurs gènes (COR=régulés par le froid et SR=facteurs d’épissage) contenant au moins un intron durant l’acclimatation au froid chez le blé (Triticum aestivum) durant l’acclimatation au froid. Nous avons appris que le froid n’agit pas sur tous les gènes de la même façon. Sur les 18 gènes COR analysés, un seul a présenté des signes d’épissage alternatif (EA) induit par le froid, et cinq ont présenté une variation d’expression significative (au moins 20 fois) induite par le froid. Chez les gènes SR, les candidats présentant l’EA furent plus nombreux, car au moins 5 ont été détecté. Nous avons décidé de prédire l’impact de l’EA sur les gènes SR, ceci par l’analyse bio-informatique d’un gène SR (SRp30). C’est ainsi que nous avons observé des modifications de la séquence nucléique chez différents isoformes de SRp30 par l’EA, tel que l’apparition d’un codon d’arrêt précoce. Ce dernier causerait une modification de la protéine sérine/arginine (SR), soit par la perte d’une grande partie de la séquence protéique, soit par la perte d’une partie de la région riche en sérine et arginine. Lors de cette analyse, nous avons appris que de ces cinq gènes COR analysés, certains n’avaient pas été caractérisés. Raison pour laquelle comme second objectif, nous avons commencé la caractérisation de l’un d’entre eux (NC2 qui coderait pour une protéine de 156 acides aminés) afin d’étudier sa contribution dans l’acclimatation au froid. Les analyses bioinformatiques indiquent que NC2 coderait pour une protéine possédant un domaine transmembranaire, une région hydrophobe en hélices α et un domaine ayant la propriété de former une superhélice. À l’issue de cette étude, nous avons appris que certains gènes SR et COR présentent un EA induit par le froid et ceci peut influencer les variantes protéiques présentes durant l’acclimatation au froid. De plus, notre étude bio-informatique sur NC2 montre qu’il est possible d’identifier/suggérer que des propriétés spécifiques joueraient des rôles fonctionnels qui contribueraient à l’acclimatation au froid. ___________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Triticum aestivum, acclimatation au froid, modifications de l’expression, épissage alternatif, gène Sérine/Arginine, gène COR

Type:	Mémoire accepté
Informations complémentaires:	Le mémoire a été numérisé tel que transmis par l'auteur.
Directeur de thèse:	Danyluk, Jean
Mots-clés ou Sujets:	Blé d'hiver / Adaptation au froid / Acclimatation / Épissage alternatif / Expression génique / Gènes COR
Unité d'appartenance:	Faculté des sciences > Département de chimie Faculté des sciences > Département des sciences biologiques
Déposé par:	Service des bibliothèques
Date de dépôt:	09 avr. 2019 07:31
Dernière modification:	09 avr. 2019 07:31
Adresse URL :	http://archipel.uqam.ca/id/eprint/12421

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