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Szathmary, Laszlo; Valtchev, Petko; Napoli, Amedeo; Godin, Robert; Boc, Alix et Makarenkov, Vladimir (2014). « A fast compound algorithm for mining generators, closed itemsets, and computing links between equivalence classes ». Annals of Mathematics and Artificial Intelligence, 70(1-2), pp. 81-105.

Joly, Simon; Lord, Etienne; Leclercq, Mickael; Boc, Alix; Diallo, Abdoulaye Baniré et Makarenkov, Vladimir (2012). « Armadillo 1.1: An Original Workflow Platform for Designing and Conducting Phylogenetic Analysis and Simulations ». PLoS ONE, 7(1), e29903.

Boc, Alix (2012). « Détection des transferts horizontaux de gènes : modèles et algorithmes appliqués à l'évolution des espèces et des langues » Thèse. Montréal (Québec, Canada), Université du Québec à Montréal, Doctorat en informatique.

Badescu, Dunarel; Boc, Alix; Diallo, Abdoulaye et Makarenkov, Vladimir (2011). « Detecting genomic regions associated with a disease using variability functions and Adjusted Rand Index ». BMC Bioinformatics, 12(Suppl), S9.

Makarenkov, Vladimir; Boc, Alix; Xie, Jingxin; Peres-Neto, Pedro; Lapointe, François-Joseph et Legendre, Pierre (2010). « Weighted bootstrapping: a correction method for assessing the robustness of phylogenetic trees ». BMC Evolutionary Biology, 10(1), p. 250.