Un nouvel algorithme bioinformatique pour retrouver la relation entre la phylogénie et la phylogéographie des espèces

Badran, Nancy (2018). « Un nouvel algorithme bioinformatique pour retrouver la relation entre la phylogénie et la phylogéographie des espèces » Mémoire. Montréal (Québec, Canada), Université du Québec à Montréal, Maîtrise en informatique.

Fichier(s) associé(s) à ce document :

Prévisualisation	PDF Télécharger (8MB)

Résumé

Dès l'essor de la phytogéographie, de nombreux chercheurs ont tenté d'expliquer le mécanisme qui régit la distribution géographique des espèces. Cependant, la plupart des recherches sur ce sujet souffrent du manque d'algorithmes performants. Dans cette étude bioinformatique, nous désirons identifier des gènes ou des fragments de gènes qui déterminent la distribution géographique des espèces. L'objectif principal de cette étude consiste à identifier la relation entre la génétique et la phytogéographie des espèces à l'aide d'un nouvel algorithme que nous avons développé, puis implémenté en langage Java. Dans le but de développer notre algorithme, nous nous sommes basés sur la théorie des graphes, les techniques de reconstruction d'arbres phylogénétiques, ainsi que sur les distances topologiques entre les arbres, comme par exemple la distance de Robinson et Foulds. Nous avons testé notre algorithme en l'appliquant à un jeu de données de 52 mammifères carnivores localisés en Amérique du Nord. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : phytogéographie, arbre phylogénétique, distance topologique, algorithme bioinformatique, ADN, acide aminé.

Type:	Mémoire accepté
Informations complémentaires:	Le mémoire a été numérisé tel que transmis par l'auteur.
Directeur de thèse:	Makarenkov, Vladimir
Mots-clés ou Sujets:	Bio-informatique / Algorithmes / Phylogéographie / Phylogenèse / Distribution géographique des espèces / Génétique / Gènes
Unité d'appartenance:	Faculté des sciences > Département d'informatique
Déposé par:	Service des bibliothèques
Date de dépôt:	13 août 2018 13:42
Dernière modification:	13 août 2018 13:42
Adresse URL :	http://archipel.uqam.ca/id/eprint/11528

Modifier les métadonnées (propriétaire du document)

Statistiques