Ortiz Suarez, Nicolas Fernando
(2025).
« Functional diversity of sessile and planktonic microbial communities in a simulated aquifer system » Mémoire.
Montréal (Québec), Université du Québec à Montréal, Maîtrise en biologie.
Fichier(s) associé(s) à ce document :
Résumé
Les aquifères constituent des ressources vitales pour l’eau potable, environ un tiers de la population mondiale dépendant des eaux souterraines pour un usage domestique. Les microorganismes des écosystèmes souterrains jouent un rôle crucial dans le recyclage de la matière organique, la dégradation des contaminants et l’amélioration de la qualité de l’eau. Cependant, les connaissances fonctionnelles sur les communautés microbiennes en biofilm dans les aquifères restent limitées, principalement en raison des difficultés liées à l’échantillonnage des carottes du sous-sol. Pour répondre à cette question, nos objectifs étaient de (I) étudier les caractéristiques fonctionnelles potentielles des communautés microbiennes sessiles (biofilm) et planctoniques, et (II) comparer leurs profils fonctionnels entre les saisons d’été et hiver. Nous avons utilisé un bioréacteur simulant un système aquifère pour étudier les deux communautés en même temps et avons appliqué des méthodes métagénomiques pour caractériser leurs traits fonctionnels potentiels. Nos résultats ont montré que le type de communauté avait un effet significatif sur l’abondance relative de tous les gènes. Les communautés planctoniques présentaient une abondance plus élevée des gènes liés au métabolisme du carbone et aux fonctions essentielles de base, tandis que les communautés sessiles avaient une abondance plus importante des voies de dégradation des polluants et du métabolisme de l’azote. La variable saison n’avait pas d’effet sur l’abondance globale des gènes ; cependant, en été, certaines voies semblaient enrichies, notamment celles liées à la production d’énergie, à la réponse au stress et à la compétition. En revanche, l’hiver semblait favoriser un état plus dormant, comme l’indiquent les voies enrichies moins nombreuses observées. Nos résultats suggèrent que, même si les communautés sessiles et planctoniques proviennent de la même source, elles peuvent adopter des stratégies métaboliques différentes pour s’adapter à leur mode de vie respectif. Il est possible que l’effet du biofilm influence et façonne les traits fonctionnels potentiels des microorganismes vivant dans les aquifères. Enfin, nous pensons que ce projet pourra servir de base à des travaux futurs pour mieux comprendre les communautés microbiennes et leurs fonctions dans d’autres aquifères au Canada. Cette étude montre le potentiel des communautés microbiennes souterraines pour recycler la matière organique et métaboliser les polluants, contribuant ainsi à améliorer l’équilibre de l’eau et des nutriments.
_____________________________________________________________________________
MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Cycle biochimique, Métabolisme, Eau souterraine, Fonctions, Bioréacteur
| Type: |
Mémoire accepté
|
| Informations complémentaires: |
Fichier numérique reçu et enrichi en format PDF/A. |
|
Directeur de thèse: |
Lazar, Cassandre |
| Mots-clés ou Sujets: |
Eau souterraine / Micro-organismes / Biofilms / Traits fonctionnels / Écologie microbienne aquatique / Cycles biogéochimiques |
| Unité d'appartenance: |
Faculté des sciences > Département des sciences biologiques |
| Déposé par: |
Service des bibliothèques
|
| Date de dépôt: |
28 janv. 2026 10:03 |
| Dernière modification: |
28 janv. 2026 10:03 |
| Adresse URL : |
http://archipel.uqam.ca/id/eprint/19563 |
RECHERCHER
PARCOURIR
LIBRE ACCÈS
