Issa Baban Chawaï, Abdoulaye
(2025).
« Conception de méthodes et de procédures de simulation pour l'évaluation des mutations à partir de données génomiques, phénotypes et environnementaux » Mémoire.
Montréal (Québec), Université du Québec à Montréal, Maîtrise en informatique.
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Résumé
Les caractères observés (phénotype) des êtres vivants correspondent à une association entre les caractéristiques génétiques et celles de l’environnement noté P= GxE (Génome x Environnement). En élevage de précision, les généticiens essayent de maîtriser les caractéristiques génétiques pour améliorer les phénotypes de leurs animaux au niveau de la résilience des animaux aux maladies, à l’environnement, à la santé, etc. Mais cela inclut aussi l’amélioration de la production, comme dans l’industrie bovine où la production de lait peut être améliorée. Ainsi, comment pouvons-nous intégrer toutes ces informations dans un modèle mathématique cohérent afin d’améliorer le phénotype tout en permettant de simuler les différents paramètres de modèle en permettant des prédictions du phénotype chez la vache ? Les travaux réalisés dans le cadre de ce mémoire s’articulent essentiellement sur deux axes : d'une part, la création d’une méthode permettant de générer la population bovine et d’autre part, l’étude de l’interaction environnement et génotype (GxE) entre les bovins de notre population créée en utilisant la méthode BLUP, ceci dans le but de faire une meilleure prédiction de la quantité de lait produite par chaque bovin et aussi d'identifier les SNP responsables d’une augmentation ou d’une diminution de la quantité de lait chez un bovin. Dans cette optique, nous avons d'abord conçu un algorithme de création de la population. Puis, en tenant compte des relations existant entre nos différents génotypes qui sont représentés par les bovins et l’environnement dans lequel ces bovins vivent, nous avons mis sur pied un outil qui permet de modéliser les interactions entre chaque génotype de notre population avec son environnement (GxE) dans le but de quantifier et d’interpréter notre phénotype d’étude qui est la quantité de lait produit par chaque bovin. Les méthodes et algorithmes développés se sont avérés efficaces, puisqu'ils nous permettent d’obtenir une erreur résiduelle proche de zéro concernant nos prédictions sur la quantité de lait produite par nos différents bovins.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : interaction génotype-environnement, corrélation génétique, norme de réaction, vaches laitières, race, sélection, modèles mixtes, mutation, phénotype, génotype, environnement, GEI, BLUP
| Type: |
Mémoire accepté
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| Informations complémentaires: |
Fichier numérique reçu et enrichi en format PDF/A. |
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Directeur de thèse: |
Diallo, Abdoulaye Baniré |
| Mots-clés ou Sujets: |
Interaction génotype-environnement / Modélisation / Phénotypes / Mutation / Vaches laitières / Production laitière / Prévision / Modèle BLUP (Best Linear Unbiased Prediction) |
| Unité d'appartenance: |
Faculté des sciences > Département d'informatique |
| Déposé par: |
Service des bibliothèques
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| Date de dépôt: |
23 janv. 2026 15:26 |
| Dernière modification: |
23 janv. 2026 15:26 |
| Adresse URL : |
http://archipel.uqam.ca/id/eprint/19550 |
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